Когда я машу рукой, то я машу всеми молекулами руки — но неправильно ведь говорить о молекулах, когда говорим о размахивании рукой? И неправильно «махать телом» (слишком большой объект). Поэтому «машу рукой» — машу системой, находящей на много системных уровней выше, чем молекулы, но всё-таки ниже уровня целого тела.